物种累积曲线

累积曲线（Accumulative Curve）也称稀释曲线 (Rarefaction Curve)，在微生物组研究中被用于评估测序量或样本量的饱和情况。稀释曲线通过从每个样本中随机抽取一定数量的序列（即在不超过现有样本测序量的某个深度下进行重新抽样），可以预测在一系列给定的测序深度下，所可能包含的物种总数及其中每个物种的相对丰度。因此，通过绘制稀释曲线，还可以在相同测序深度下，通过比较样本中物种数的多少，从而在一定程度上衡量每个样本的多样性高低，宏基因组使用物种数量作稀疏曲线分析。

常见问题

Q：物种累积曲线具体怎么做的？有什么用？怎么看？

A：按照不同的分组，对组内的样本进行重采样，横坐标是重采样的数量，随着采样数量的增加，组内样本含有的数量逐渐增加，并进入一个平台期（增加曲线组间变缓），此时表明组内的样本数量足够多，多到可以代表这一分组的群落组成了，再增加组内的样本数量也不会增加组内物种的数量。

正是因为如此，所以物种累积曲线分析，对组内样本数量有要求。最少的样本数是 3，但仍然推荐数量越多越好。